linux--5、文本文件編輯命令

cat命令用于查看純文本文件(較短的)：

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$ cat [選項] 文件

以下是cat命令常用的3個選項：

(1) $ cat -n 文件

-n 表示顯示行號。

(2) $ cat -b 文件

-b 表示顯示行號，但是不包括空行。

(3) $ cat -A 文件

-A 表示顯示出不可見的符號，如空格、tab鍵等。

more命令用于查看純文本文件(較長的)：

$ more [選項] 文件

more命令常用的一個參數是"- 數字"，表示預先顯示的行數，默認是一頁：

$ more -10 文件

head命令用于查看純文本文檔的前N行：

$ head [選項] 文件

(1) $ head -n 10 文件

這個命令表示顯示文件的前10行。

(2) $ head -n -10 文件

這個命令表示正常輸出，但是不顯示最后的10行。

tail命令用于查看純文本文檔的后N行：

$ tail [選項] [文件]

例如，顯示文件/etc/passwd的后10行：

$ tail -n 10 /etc/passwd

wc命令用于統計指定文本的行數、字數、字節數：

$ wc [參數] 文本

(1) $ wc -l 文本

-l 參數表示只顯示行數。

(2) $ wc -w 文本

-w 參數表示只顯示單詞數。

(3) $ wc -c 文本

-c 參數表示只顯示字節數。

Linux 編輯文本命令

一、vi編輯器有3種基本工作模式

分別是：命令模式、文本輸入模式、和末行模式。

第一：命令行模式：

該模式是進入vi編輯器后的默認模式。任何時候，不管用戶處于何種模式，按下ESC鍵即可進入命令模式。在該模式下，用戶可以輸入vi命令，用戶管理自己的文檔。此時從鍵盤上輸入的任何字符都被當作編輯命令來解釋。若輸入的字符是合法的vi命令，則vi在接受用戶命令之后完成相應的動作。但需要注意的是，所輸入的命令并不回顯在屏幕上。若輸入的字符不是vi命令，vi會響鈴報警。

第二：文本輸入模式：

在命令模式下輸入命令i、附加命令a、打開命令o、修改命令c、取代命令r或替換命令s都可以進入文本輸入模式。在該模式下，用戶輸入的任何字符都被vi當作文件內容保護起來，并將其顯示在屏幕上。在文本輸入過程中，若想回到命令模式下，按ESC鍵即可。

第三：末行模式：

末行模式也稱ex轉義模式。在命令模式下，用戶按“：”鍵即可進入末行模式下，此時vi會在顯示窗口的最后一行（通常也是屏幕的最后一行）顯示一個“：”作為末行模式的說明符，等待用戶輸入命令。多數文件管理命令都是在此模式下執行的（如把編輯緩沖區的內容寫到文件中等）。末行命令在執行完后，vi自動回到命令模式。如果要從命令模式轉換到編輯模式，可以鍵入a或者i。如果需要從文本模式返回，則按ESC即可。在命令模式下輸入“:”即可切換到末行模式，然后輸入命令。

實例演示

首先我們使用命令 vi filename 打開一個文件，這個時候進入到的是命令模式

接下來我們按i，然后鍵盤隨便輸入寫內容。

然后按ESC重新進入到命令模式。

在命令模式的情況下，我們按：，進入到了末行模式。

我們輸入wq!，然后回車，強行保存退出。

下次我們再打開對應文件（可用less filename命令打開），即可看到內容已經更改。

補充：

（1）末行模式下：q! 【強制退出不保存】 q【退出不保存】 wq【退出并保存后面也可以加個！】

（2）如果你不想保存直接退出有可以在命令模式下使用“ctrl+z”快捷鍵或者按住“shift”鍵，輸入兩個z即可退出。

更多命令

進入vi的命令：

vi filename :打開或新建文件，并將光標置于第一行首

vi +n filename ：打開文件，并將光標置于第n行首

vi + filename ：打開文件，并將光標置于最后一行首

vi +/pattern filename：打開文件，并將光標置于第一個與pattern匹配的串處

vi -r filename ：在上次正用vi編輯時發生系統崩潰，恢復filename

vi filename….filename ：打開多個文件，依次進行編輯

屏幕翻滾類命令：

Ctrl+u：向文件首翻半屏

Ctrl+d：向文件尾翻半屏

Ctrl+f：向文件尾翻一屏

Ctrl＋b；向文件首翻一屏

nz：將第n行滾至屏幕頂部，不指定n時將當前行滾至屏幕頂部。

插入文本類命令：

i ：在光標前

I ：在當前行首

a：光標后

A：在當前行尾

o：在當前行之下新開一行

O：在當前行之上新開一行

r：替換當前字符

R：替換當前字符及其后的字符，直至按ESC鍵

s：從當前光標位置處開始，以輸入的文本替代指定數目的字符

S：刪除指定數目的行，并以所輸入文本代替之

ncw或nCW：修改指定數目的字

nCC：修改指定數目的行

刪除命令：

ndw或ndW：刪除光標處開始及其后的n-1個字

do：刪至行首

d$：刪至行尾

ndd：刪除當前行及其后n-1行

x或X：刪除一個字符，x刪除光標后的，而X刪除光標前的

Ctrl+u：刪除輸入方式下所輸入的文本

搜索及替換命令：

/pattern：從光標開始處向文件尾搜索pattern

?pattern：從光標開始處向文件首搜索pattern

n：在同一方向重復上一次搜索命令

N：在反方向上重復上一次搜索命令

：s/p1/p2/g：將當前行中所有p1均用p2替代

：n1,n2s/p1/p2/g：將第n1至n2行中所有p1均用p2替代

：g/p1/s//p2/g：將文件中所有p1均用p2替換

撤銷回退命令：

u 撤銷上一步的操作

Ctrl+r 恢復上一步被撤銷的操作

選項設置：

all：列出所有選項設置情況

term：設置終端類型

ignorance：在搜索中忽略大小寫

list：顯示制表位(Ctrl+I)和行尾標志（$)

number：顯示行號

report：顯示由面向行的命令修改過的數目

terse：顯示簡短的警告信息

warn：在轉到別的文件時若沒保存當前文件則顯示NO write信息

nomagic：允許在搜索模式中，使用前面不帶“\”的特殊字符

nowrapscan：禁止vi在搜索到達文件兩端時，又從另一端開始

mesg：允許vi顯示其他用戶用write寫到自己終端上的信息

末行模式命令：

：n1,n2 co n3：將n1行到n2行之間的內容拷貝到第n3行下

：n1,n2 m n3：將n1行到n2行之間的內容移至到第n3行下

：n1,n2 d ：將n1行到n2行之間的內容刪除

：w ：保存當前文件

：e filename：打開文件filename進行編輯

：x：保存當前文件并退出

：q：退出vi

：q!：不保存文件并退出vi

：wq：保存并退出

：!command：執行shell命令command

：n1,n2 w!command：將文件中n1行至n2行的內容作為command的輸入并執行之，若不指定n1，n2，則表示將整個文件內容作為command的輸入

：r!command：將命令command的輸出結果放到當前行

寄存器操作：

“?nyy：將當前行及其下n行的內容保存到寄存器？中，其中?為一個字母，n為一個數字

“?nyw：將當前行及其下n個字保存到寄存器？中，其中?為一個字母，n為一個數字

“?nyl：將當前行及其下n個字符保存到寄存器？中，其中?為一個字母，n為一個數字

“?p：取出寄存器？中的內容并將其放到光標位置處。這里？可以是一個字母，也可以是一個數字

ndd：將當前行及其下共n行文本刪除，并將所刪內容放到1號刪除寄存器中。

Linux文本操作常用命令

在Linux系統里常用于文本查看、操作、統計的命令：

通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）

接下來通過示例把10個命令的常用參數和用法展示出來：

參數的用法介紹：

注意事項：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看

結合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比較少

3.1 less命令

less [參數] 文件名

less命令重要的補充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵

less命令重要的補充用法2 ：

參數用法：

less命令 不加參數 查看文件：

less命令加 -N參數 查看文件：顯示行號

less命令加 -S參數 查看文件：單行顯示，非常規整

對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好

查看壓縮文件

wc 統計字符是也把換行符統計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。

常見參數:

切記：用less命令，按q退出

cut命令是按關鍵詞來切的

常見參數:

排列前：

排列后：

解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一個表格結構時，因為制表符對齊的原因，出現一個錯位的現象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數 ， 讓數值有數學意義上的大小來排序 。

uniq命令去重，只有兩行出現重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現兩行一模一樣，不會去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

換其它文件試試

總之，uniq命令使用時經常和sort一起

常見參數:

常見用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常見用法2 : paste - -

常見參數:

要養成一個好習慣，原始數據不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符傳遞給 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的內容

3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列

4. 在第3步的基礎上排序、去重復并統計

5. 在第4步的基礎上，將空格替換成制表符

補充小知識 ：

清屏 ：control L

查看歷史（輸入過的）命令 ：history